島津氣相色譜柱的直徑為數毫米，其中填充有固體吸附劑或液體溶劑，所填充的吸附劑或溶劑稱為固定相。與固定相相對應的還有一個流動相。流動相是一種與樣品和固定相都不發生反應的氣體，一般為氮或氦氣。待分析的樣品在色譜柱頂端注入流動相，流動相帶著樣品進入色譜柱，故流動相又稱為載氣。載氣在分析過程中是連續地以一定流速流過色譜柱的，而樣品則只是一次一次地注入，每注入一次得到一次分析結果。樣品在色譜柱中得以分離是基于熱力學性質的差異。固定相與樣品中的各組分具有不同的親合力。當載氣帶著樣品連續地通過色譜柱時，親合力大的組分在色譜柱中移動速度慢，因為親合力大意味著固定相拉住它的力量大。親合力小的則移動快。

　　島津氣相色譜柱的安裝：

　　首先，當然是色譜柱的安裝。安裝色譜柱可以說是氣相色譜使用的入門級操作，大家一般情況下都是駕輕就熟的。但是，有幾個問題還是要提起注意：

　　1、先將密封墊套在柱頭上，此時應將柱頭朝下，避免密封墊碎屑進入柱內而造成堵塞。

　　將石墨墊套在柱頭后，應將柱頭截去1-2cm。可用專門的柱切割器，也可用安倍瓶開瓶瓷片，在柱上輕劃一下，然后掰斷。這樣可以保證柱端是整潔的，又避免了柱頭污染物對分析的干擾，因為截去了穿過密封墊時可能進入柱頭的污染物，或者運輸過程中可能損壞的柱端。

　　2、柱端伸出密封墊的長度不同儀器有不同的規定，應嚴格按照儀器說明書確定。

　　總原則是進樣口一端安裝好后，柱端應處于分流點以上，位于襯管中央。檢測器一端則是柱出口盡量接近檢測點，以避免死體積造成的柱外效應。為保證柱端伸出的長度準確，可以截去柱端后，先量好柱頭伸出的長度，然后在接頭下方的色譜柱上做標記，擰緊街頭后保證該標記正好位于接頭端面。這樣就避免了擰緊過程中色譜柱移動可能造成的伸出長度不準確。

　　3、接頭不要擰得太緊，以免將色譜柱壓裂或者壓碎。

　　一般新的石墨墊用手擰緊后再用扳手擰1/4圈即可。如果是重復使用的石墨墊，則要多擰緊點，直到用手輕輕拉色譜柱拉不動為止。原則上每次安裝色譜柱都要用新的石墨墊，不過同一色譜柱拆下再安裝時，可重復使用石墨墊，但重復使用次數不要超過3次，否則會失去密封性。